红外穿透的工作原理是利用被固定的红外二极管传感器的发光管部分发出固定波长的不可见红外光，穿透经过的纸币后，由对面的接收管接收到的剩余光进行针对纸币的纸张和覆盖的印刷油墨的特性进行分析，并和标准值进行比较判断。

1. 红外信号与人民币的特性

人民币的纸张比较坚固、密度较高以及用凹印技术印刷的油墨厚度较高，因而对红外信号的吸收能力较强来辨别钞票的真假。但钞票的纸质特征与假钞的纸质特征有一定的差异，用红外信号对钞票进行穿透检测时，它们对红外信号的吸收能力将会不同，通过这种方式可以实现辨伪。

2. 数学运算与比较分析

油墨的颜色与厚度同样会造成红外穿透能力的差异，因此必须对红外穿透检测的信号进行数学运算和比较分析，以区分真伪。这种技术能够在短时间内、精准地鉴定人民币的真伪，节约了商家的时间与精力。

3. 可视的红外图像检测仪

国际市场上存在另外一种可视的红外图像检测仪产品，其工作原理为若干只正确波长的红外发光二极管发出不可见红外光，用装有特殊滤光片的摄像头将纸币的红外图像进行摄录，并显示在显示屏上(显示屏有CRT和液晶LCD两类)。这种设备可以显示钞票的红外图像，更方便用户对钞票真假的判断，在超级假美金泛滥的俄罗斯地区大量销售。